Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp5P56399 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp5P56399 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms