Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atp5g3P56384 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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