Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Epb41l4aP52963 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41l4aP52963 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Epb41l4aP52963 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epb41l4aP52963 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms