Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgd1P52734 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd1P52734 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms