Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2e3P52483 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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