Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LtbrP50284 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms