Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkn1cP49919 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkn1cP49919 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms