Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtpreP49446 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtpreP49446 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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