Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp3P49194 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms