Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd1P48410 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd1P48410 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms