Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rfx2P48379 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rfx2P48379 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rfx2P48379 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfx2P48379 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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