Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl13P47963 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms