Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TfamP40630 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TfamP40630 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TfamP40630 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TfamP40630 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms