Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtlP38585 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtlP38585 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtlP38585 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtlP38585 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtlP38585 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtlP38585 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtlP38585 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtlP38585 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtlP38585 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtlP38585 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TtlP38585 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TtlP38585 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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