Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprkP35822 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprkP35822 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms