Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin1P35438 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grin1P35438 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin1P35438 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grin1P35438 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms