Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2aP35436 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin2aP35436 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin2aP35436 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin2aP35436 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin2aP35436 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms