Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms