Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms