Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Slc6a9P28571 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms