Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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