Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gjb1P28230 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms