Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl3P27659 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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