Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms