Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChgaP26339 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChgaP26339 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChgaP26339 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms