Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsta3P23591 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms