Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RarbP22605 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RarbP22605 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RarbP22605 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RarbP22605 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RarbP22605 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms