Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prim1P20664 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms