Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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