Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18530 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18530 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18530 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18530 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18530 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18530 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms