Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calb1P12658 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms