Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms