Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lamp1P11438 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms