Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd4P10628 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms