Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf1P09925 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Surf1P09925 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Surf1P09925 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms