Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms