Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
AurkcO88445 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
AurkcO88445 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms