Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfdp1O88271 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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