Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec11aO88200 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms