Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cbx4O55187 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cbx4O55187 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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