Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlkO54988 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlkO54988 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlkO54988 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlkO54988 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms