Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DffaO54786 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DffaO54786 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DffaO54786 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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