Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FxnO35943 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FxnO35943 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FxnO35943 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FxnO35943 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FxnO35943 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FxnO35943 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FxnO35943 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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