Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sp100O35892 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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Sp100O35892 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sp100O35892 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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