Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Clk2O35491 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk2O35491 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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