Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TnxbO35452 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
TnxbO35452 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
TnxbO35452 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TnxbO35452 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TnxbO35452 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms