Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Dgcr6O35347 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms