Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Bhlhe40O35185 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Bhlhe40O35185 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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