Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pitx3O35160 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms