Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Eftud2O08810 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms